La communauté est gérée par un Conseil de Communauté composé des délégués des conseils municipaux des communes. Il élit un Président qui dirige l’administration de la Communauté. Certaines décisions importantes sont prises à la majorité qualifiée (50% des communes représentant 2/3 de la population ou 2/3 des communes représentant 50% de la population et le vote positif de la commune représentant 25% de la population).

Depuis le nouveau recensement, la population du territoire de la Communauté de Communes Seine Mauldre est passée de 18 000 à 18 925 habitants, répartis comme suit : Aubergenville : 12 217 Aulnay-sur-Mauldre : 1 165 Bouafle : 2 184 Flins-sur-Seine : 2 406 Nezel : 953